羊驼的消化系统特点对羊驼适于恶劣气候有着重要的意义。
　　羊驼有三个胃，胃室-1（C-1）、胃室-2（C-2）和胃室-3（C-3），其解剖学特点与真正反刍动物明显不同。这三个胃室都有腺区。C-2的粘膜层中除了一小部分不甚弯曲处都是有腺区，整个C-3的粘膜上都有腺体，C-3末端1/3含有真正的胃腺。
　　由于羊驼与真正反刍动物在解剖学及生理学上存在着重大的差异，因此其消化机能也不同。羊驼对蛋白质和纤维的消化利用率很高。
　　一般干草和农作物的秸杆都是羊驼很好的采食和消化的饲料，通过研究表明，羊驼在低营养水平的条件下，所产的毛更细、质量更好。